|
|
Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
Data corrente: |
16/10/2023 |
Data da última atualização: |
19/10/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
Autoria: |
LEONI, G.; BUZANSKAS, M. E.; MARCONDES, C. R.; REGITANO, L. C. de A.; MUNARI, D. P.; BERNARDES, P. A. |
Afiliação: |
GABRIELA LEONI, Universidade Federal de Santa Catarina; MARCOS ELI BUZANSKAS, Universidade Federal da Paraíba; CINTIA RIGHETTI MARCONDES, CPPSE; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; DANÍSIO PRADO MUNARI, Universidade Estadual Paulista; PRISCILA ARRIGUCCI BERNARDES, University Institute for Future Farming System. |
Título: |
Imputação utilizando painéis personalizados em bovinos da raça Canchim. |
Ano de publicação: |
2023 |
Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 15., 2023, Jataí. O reinado dos fenótipos: novos desafios. Anais.... Jataí: SBMA, 2023. |
Páginas: |
p. 120-122. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Uma alternativa para reduzir o custo da aplicação da seleção genômica é a realização da imputação dos genótipos. No entanto, para raças em que a população é pequena, há indisponibilidade de grande quantidade de animais genotipados com alta densidade, como observado para raça Canchim. A utilização de raças fundadoras pode colaborar com a imputação, porém algumas vezes resulta em baixa acurácia. Assim, o objetivo deste estudo foi comparar a acurácia de imputação de painéis comerciais com painéis personalizados de baixa densidade imputados para um painel de alta densidade em bovinos da raça Canchim, utilizando população referência formada por animais da raça Nelore. Foram utilizados 400 animais Nelore na população referência e 396 animais Canchim e do grupo genético MA na população de imputação. Os painéis comerciais de baixa densidade considerados continham 20 mil e 50 mil SNPs (polimorfismos de nucleotídeo único) e 3 tipos de personalizações foram aplicadas com o objetivo de obter as mesmas densidades dos painéis comerciais, formando assim 8 diferentes cenários. A acurácia de imputação apresentou valores superiores nos painéis personalizados quando comparados com os comerciais e também, conforme a densidade dos painéis eram maiores, as acurácias tiveram seu valor aumentado. Houve pequena diferença entre a primeira forma de personalizar o painel comparado com a segunda e terceira, indicando que a maneira como o painel é construído interfere nas acurácias de imputação. |
Palavras-Chave: |
Bovino de corte; Genômica; Marcadores moleculares. |
Thesagro: |
Gado Canchim. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1157271/1/ImputacaoUtilizandoPaineis.pdf
|
Marc: |
LEADER 02308nam a2200229 a 4500 001 2157271 005 2023-10-19 008 2023 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aLEONI, G. 245 $aImputação utilizando painéis personalizados em bovinos da raça Canchim.$h[electronic resource] 260 $aIn: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 15., 2023, Jataí. O reinado dos fenótipos: novos desafios. Anais.... Jataí: SBMA$c2023 300 $ap. 120-122. 520 $aUma alternativa para reduzir o custo da aplicação da seleção genômica é a realização da imputação dos genótipos. No entanto, para raças em que a população é pequena, há indisponibilidade de grande quantidade de animais genotipados com alta densidade, como observado para raça Canchim. A utilização de raças fundadoras pode colaborar com a imputação, porém algumas vezes resulta em baixa acurácia. Assim, o objetivo deste estudo foi comparar a acurácia de imputação de painéis comerciais com painéis personalizados de baixa densidade imputados para um painel de alta densidade em bovinos da raça Canchim, utilizando população referência formada por animais da raça Nelore. Foram utilizados 400 animais Nelore na população referência e 396 animais Canchim e do grupo genético MA na população de imputação. Os painéis comerciais de baixa densidade considerados continham 20 mil e 50 mil SNPs (polimorfismos de nucleotídeo único) e 3 tipos de personalizações foram aplicadas com o objetivo de obter as mesmas densidades dos painéis comerciais, formando assim 8 diferentes cenários. A acurácia de imputação apresentou valores superiores nos painéis personalizados quando comparados com os comerciais e também, conforme a densidade dos painéis eram maiores, as acurácias tiveram seu valor aumentado. Houve pequena diferença entre a primeira forma de personalizar o painel comparado com a segunda e terceira, indicando que a maneira como o painel é construído interfere nas acurácias de imputação. 650 $aGado Canchim 653 $aBovino de corte 653 $aGenômica 653 $aMarcadores moleculares 700 1 $aBUZANSKAS, M. E. 700 1 $aMARCONDES, C. R. 700 1 $aREGITANO, L. C. de A. 700 1 $aMUNARI, D. P. 700 1 $aBERNARDES, P. A.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
Registros recuperados : 9 | |
2. | | SOUCHIE, E. L.; SILVA, E. M. R.; SAGGIN-JÚNIOR, O. J.; CAMPÉLLO, E. F. C.; AZCÓN, R.; BAREA, J. M. Influência de isolados de bactérias solubilizadoras de fosfato na germinação e crescimento micelial de fungos micorrízicos arbusculares em meio axênico. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOBIA, 22., 2003, Florianópolis. Resumos... Florianópolis: SBM, 2003. 1 p.Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
| |
4. | | SOUCHIE, E. L.; AZCÓN, R.; BAREA, J. M.; SAGGIN JUNIOR, O. J.; SILVA, E. M. R. da. Phosphate solubilization and synergism between P-solubilizing and arbuscular mycorrhizal fungi. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 41, n. 9, p. 1405-1411, set. 2006 Título em português: Solubilização de fosfatos e sinergismo entre fungos solubilizadores de fosfato e micorrízicos arbusculares.Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
| |
5. | | SOUCHIE, E. L.; SILVA, E. M. R. da; SAGGIN JÚNIOR, O. J.; AZCÓN, R.; BAREA, J. M. Sinergismo de hongos solubilizadores de fosfato y hongos micorrícicos arbusculares sobre el crecimiento y nutrición del trébol. In: ASCONEGUI, M. A. M. de; GARCÍA DE SALAMONE, I. E.; MIYAZAKI, S. S. Biología del suelo: transformaciones de la materia orgánica, usos y biodiversidad de los organismos edáficos. Buenos Aires: Universidad de Buenos Aires, 2004. p. 195-200.Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
| |
6. | | SOUCHIE, E. L.; SILVA, E. M. R.; SAGGIN-JÚNIOR, O. J.; CAMPELLO, E. F. C.; AZCÓN, R.; BAREA, J. M. Solubilização de fosfato de cálcio, alumínio e apatita de araxá em meio sólido e líquido por microrganismos solubilizadores. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 22., 2003, Florianópolis. Resumos... Florianópolis: SBM, 2003. 1 p.Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
| |
7. | | SOUCHIE, E. L.; AZCÓN, R.; BAREA, J. M.; SAGGIN JUNIOR, O. J.; SILVA, E. M. R. da. Solubilização de fosfatos em meios sólido e líquido por bactérias e fungos do solo. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 40, n. 11, p. 1149-1152, nov. 2005 Notas Científicas.
Título em inglês: Phosphate solubilization in solid and liquid media by soil bacteria and fungi.Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
| |
8. | | SOUCHIE, E. L.; AZCÓN, R.; BAREA, J. M.; SAGGIN JÚNIOR, O. J.; SILVA, E. M. R. da. Solubilização de fosfatos em meios sólido e líquido por bactérias e fungos do solo. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 40, n. 11, p. 1149-1152, nov. 2005. Phosphate solubilization in solid and liquid media by soil bacteria and fungi.Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
| |
9. | | SOUCHIE, E. L.; SAGGIN JÚNIOR, O. J.; SILVA, E. M. R. da; CAMPELLO, E. F. C.; AZCÒN, R.; BAREA, J. M. Communities of P-solubilizing bacteria, fungi and arbuscular mycorrhizal fungi in grass pasture and secondary forest of Paraty, RJ-Brasil. Anais da Academia Brasileira de Ciências, Rio de Janeiro, v. 78, n. 1, p. 183-193, 2006. Parceria: Centro Federal de Educação Tecnológica; Estación Experimental del Zaidin.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
| |
Registros recuperados : 9 | |
|
Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|